IsoPlexis系統(tǒng)的工作原理主要基于其獨特的微流控芯片技術(shù)和自動化檢測流程，能夠在單細胞水平上實現(xiàn)高通量、多路復用的蛋白質(zhì)組學分析‌。以下是其核心工作流程：

‌單細胞捕獲與培養(yǎng)‌：

系統(tǒng)使用微流控芯片（IsoCode芯片）將單個細胞分離到微室中，并通過流體動力學設計實現(xiàn)均勻的細胞分布和培養(yǎng)環(huán)境‌。這一步驟避免了傳統(tǒng)方法中需要多個手動操作和清洗站的問題。

‌蛋白質(zhì)分泌與檢測‌：

細胞在微室內(nèi)分泌蛋白質(zhì)后，系統(tǒng)通過自動化流程加入ELISA試劑，利用夾心法對分泌的蛋白質(zhì)（如細胞因子）進行高靈敏度檢測‌。每個微室可分析多達32種蛋白，檢測范圍覆蓋2-2000pg/ml‌。

‌成像與數(shù)據(jù)分析‌：

系統(tǒng)配備高級光學組件，對微室內(nèi)的細胞和蛋白質(zhì)信號進行成像，并將數(shù)據(jù)直接導入IsoSpeak軟件平臺‌。該軟件通過算法量化單細胞水平的蛋白質(zhì)表達，生成功能蛋白譜（如細胞多功能指數(shù)PSI），用于識別細胞亞群和功能狀態(tài)‌。